Estudió en el Conservatorio de Palma de Mallorca y amplió su formación en los cursos de verano de Darmstadt y con Iannis Xenakis, entre otros. Fue director musical del Big Ensemble del Taller de Musics y director de la Orquesta del Caos. Miembro fundador con Joan Saura y Liba Villavecchia del Improvisers of Barcelona Association (IBA), de la que fue director hasta el 2001. Actualmente es profesor titular de improvisación de la Escuela Superior de Música de Cataluña y director del Festival Músiques Contemporànies de Barcelona y del ciclo «Nits de Música» de la Fundació Miró.
En 1985 apareció su primer disco Ardent, de piano solo, que marca el inicio de su carrera como improvisador libre. Desde 1992 ha editado doce CD. Ha colaborado con artistas internacionales como Tom Cora, Evan Parker, Butch Morris, Peter Kowald, Marilyn Crispell, entre otros. Además de sus conciertos en solitario como improvisador, mantiene varios proyectos estables: Trío Local, el cuarteto de jazz Agustí Fernández Quartet, dúo con la flautista americana Jane Rigier, etc. Ha sido galardonado con el premio Altaveu 2000.
